For hver art i Artsbogen nævnes en ”Dansk reference”, der angiver forekomsten af pågældende art i Danmark. En reference kan være et bogværk, et tidsskrift, et website, et upubliceret dokument eller en personlig meddelelse.

Det er ikke nødvendigvis den første eller "bedste" reference, der angives, men det tilstræbes at benytte f.eks. et autoritativt bogværk frem for en personlig meddelelse, så bl.a. derfor vil der af og til ske ændringer i den angivne reference.

Referencer til dokumentation af arters forekomst i Danmark optræder i mange former, f.eks. bøger, artikler eller upublicerede regneark.

Dansk reference angives som udgangspunkt kun for arter og underliggende taxa (underarter, varieteter og former). I tilfælde, hvor højere niveauer i Taxonbasen ikke rummer underliggende taxa, f.eks. en slægt, der kun er kendt fra fund bestemt til slægtsniveau, vil der dog evt. være angivet en reference for disse.